MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 25340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008277	AATG	2	8	96	103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008277	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008277	CAA	2	6	145	150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008277	TTC	2	6	243	248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008277	ACT	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008277	AAC	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008277	TAA	2	6	368	373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008277	AT	3	6	480	485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008277	AC	3	6	486	491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008277	CAA	2	6	507	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008277	CTA	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
13	NC_008277	ATA	2	6	640	645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114824
14	NC_008277	ATA	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114824
15	NC_008277	AGC	2	6	753	758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114824
16	NC_008277	AAAC	2	8	767	774	75 %	0 %	0 %	25 %	111114824
17	NC_008277	A	6	6	796	801	100 %	0 %	0 %	0 %	111114824
18	NC_008277	TCC	2	6	852	857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114824
19	NC_008277	TCC	2	6	954	959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114824
20	NC_008277	T	7	7	1139	1145	0 %	100 %	0 %	0 %	111114824
21	NC_008277	CTA	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
22	NC_008277	TCA	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
23	NC_008277	CAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114824
24	NC_008277	T	7	7	1236	1242	0 %	100 %	0 %	0 %	111114824
25	NC_008277	TAAA	2	8	1271	1278	75 %	25 %	0 %	0 %	111114824
26	NC_008277	T	7	7	1298	1304	0 %	100 %	0 %	0 %	111114824
27	NC_008277	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111114824
28	NC_008277	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114824
29	NC_008277	TCA	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
30	NC_008277	AAAT	2	8	1500	1507	75 %	25 %	0 %	0 %	111114824
31	NC_008277	A	7	7	1514	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	111114824
32	NC_008277	A	6	6	1522	1527	100 %	0 %	0 %	0 %	111114824
33	NC_008277	GCA	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114825
34	NC_008277	TAG	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114825
35	NC_008277	ATT	2	6	1631	1636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
36	NC_008277	CT	3	6	1639	1644	0 %	50 %	0 %	50 %	111114825
37	NC_008277	ATAC	2	8	1654	1661	50 %	25 %	0 %	25 %	111114825
38	NC_008277	ATAA	2	8	1698	1705	75 %	25 %	0 %	0 %	111114825
39	NC_008277	AT	3	6	1800	1805	50 %	50 %	0 %	0 %	111114825
40	NC_008277	T	6	6	1846	1851	0 %	100 %	0 %	0 %	111114825
41	NC_008277	TAT	2	6	1853	1858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
42	NC_008277	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114825
43	NC_008277	T	6	6	1869	1874	0 %	100 %	0 %	0 %	111114825
44	NC_008277	GAA	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
45	NC_008277	TCC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114825
46	NC_008277	CTC	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114825
47	NC_008277	AGA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
48	NC_008277	AATT	2	8	2107	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	111114825
49	NC_008277	AT	4	8	2142	2149	50 %	50 %	0 %	0 %	111114825
50	NC_008277	AAAT	2	8	2178	2185	75 %	25 %	0 %	0 %	111114825
51	NC_008277	TGACCA	2	12	2208	2219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111114825
52	NC_008277	ATT	3	9	2240	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
53	NC_008277	TAT	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
54	NC_008277	ATC	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114825
55	NC_008277	T	6	6	2342	2347	0 %	100 %	0 %	0 %	111114825
56	NC_008277	AATCA	2	10	2372	2381	60 %	20 %	0 %	20 %	111114825
57	NC_008277	AAAT	2	8	2387	2394	75 %	25 %	0 %	0 %	111114825
58	NC_008277	AAAT	2	8	2410	2417	75 %	25 %	0 %	0 %	111114825
59	NC_008277	AT	3	6	2634	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	111114825
60	NC_008277	TTTTTA	2	12	2655	2666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114825
61	NC_008277	GAAA	2	8	2711	2718	75 %	0 %	25 %	0 %	111114825
62	NC_008277	AAG	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
63	NC_008277	A	6	6	2764	2769	100 %	0 %	0 %	0 %	111114825
64	NC_008277	TAA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114825
65	NC_008277	CTT	2	6	2782	2787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114825
66	NC_008277	T	7	7	2822	2828	0 %	100 %	0 %	0 %	111114825
67	NC_008277	TTAAAC	2	12	2853	2864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114825
68	NC_008277	T	6	6	2966	2971	0 %	100 %	0 %	0 %	111114825
69	NC_008277	A	6	6	2986	2991	100 %	0 %	0 %	0 %	111114825
70	NC_008277	CATT	2	8	3007	3014	25 %	50 %	0 %	25 %	111114825
71	NC_008277	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008277	TAA	2	6	3079	3084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008277	ATT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008277	TAT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008277	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008277	A	6	6	3145	3150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008277	A	6	6	3192	3197	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
78	NC_008277	A	6	6	3254	3259	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
79	NC_008277	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
80	NC_008277	ATT	2	6	3334	3339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
81	NC_008277	AATCC	2	10	3349	3358	40 %	20 %	0 %	40 %	111114826
82	NC_008277	GGATTA	2	12	3369	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
83	NC_008277	ATT	2	6	3402	3407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
84	NC_008277	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
85	NC_008277	A	8	8	3441	3448	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
86	NC_008277	T	6	6	3456	3461	0 %	100 %	0 %	0 %	111114826
87	NC_008277	A	6	6	3497	3502	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
88	NC_008277	TGG	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111114826
89	NC_008277	ATA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
90	NC_008277	ATA	2	6	3640	3645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
91	NC_008277	TAA	2	6	3661	3666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
92	NC_008277	TAAT	2	8	3673	3680	50 %	50 %	0 %	0 %	111114826
93	NC_008277	TGA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
94	NC_008277	ATA	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
95	NC_008277	AAAGA	2	10	3842	3851	80 %	0 %	20 %	0 %	111114826
96	NC_008277	A	6	6	3857	3862	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
97	NC_008277	AAT	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
98	NC_008277	AATG	2	8	3884	3891	50 %	25 %	25 %	0 %	111114826
99	NC_008277	TCAAT	2	10	3904	3913	40 %	40 %	0 %	20 %	111114826
100	NC_008277	TA	3	6	3955	3960	50 %	50 %	0 %	0 %	111114826
101	NC_008277	ATA	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
102	NC_008277	AATG	2	8	4014	4021	50 %	25 %	25 %	0 %	111114826
103	NC_008277	CTA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
104	NC_008277	ATC	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
105	NC_008277	A	6	6	4156	4161	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
106	NC_008277	GTA	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
107	NC_008277	A	6	6	4214	4219	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
108	NC_008277	ATG	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
109	NC_008277	A	6	6	4264	4269	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
110	NC_008277	T	6	6	4277	4282	0 %	100 %	0 %	0 %	111114826
111	NC_008277	GAT	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
112	NC_008277	GATT	2	8	4357	4364	25 %	50 %	25 %	0 %	111114826
113	NC_008277	GGGA	2	8	4378	4385	25 %	0 %	75 %	0 %	111114826
114	NC_008277	TAC	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
115	NC_008277	ATT	2	6	4457	4462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
116	NC_008277	ACT	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
117	NC_008277	ACA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114826
118	NC_008277	ATC	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
119	NC_008277	A	6	6	4667	4672	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
120	NC_008277	AGG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111114826
121	NC_008277	TAA	2	6	4793	4798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
122	NC_008277	TTG	2	6	4804	4809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111114826
123	NC_008277	TAA	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
124	NC_008277	TTAT	2	8	4867	4874	25 %	75 %	0 %	0 %	111114826
125	NC_008277	CTA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
126	NC_008277	TAA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
127	NC_008277	TAA	2	6	4921	4926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
128	NC_008277	A	6	6	4925	4930	100 %	0 %	0 %	0 %	111114826
129	NC_008277	ATA	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
130	NC_008277	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008277	CAC	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008277	TTC	2	6	5019	5024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
133	NC_008277	T	6	6	5026	5031	0 %	100 %	0 %	0 %	111114827
134	NC_008277	T	7	7	5033	5039	0 %	100 %	0 %	0 %	111114827
135	NC_008277	ATTCC	2	10	5054	5063	20 %	40 %	0 %	40 %	111114827
136	NC_008277	TAC	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
137	NC_008277	CCTTG	2	10	5122	5131	0 %	40 %	20 %	40 %	111114827
138	NC_008277	TCA	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
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